På grund af områdets mangeårige betydning for drikkevandet har Brokilde aldrig været opdyrket, endsige sprøjtet. Området har derfor bevaret en varieret natur med mange forskellige planter, bl.a. hjertegræs og nøgleblomstret klokke.
For at bevare variation i floraen er det vigtigt, at de lyskrævende planter ikke skygges ihjel af græs og budskads. Derfor slås engarealerne jævnligt, som led i Københavns Energi´s (tidligere Københavns Vandforsyning´s) naturpleje.
Brokilde er et godt sted at øve sig i at kende fuglestemmer, da der i mange perioder er rig fuglekoncert.
Umiddelbart nord for kildepladsen ligger en to-kamret stendysse.